Fernando Guimarães tem publicado, desde 1956, vários livros de poesia e ensaio.
Alargou também a sua actividade à ficção e ao teatro.
Os seus livros de ensaio referem-se à literatura portuguesa desde o século XIX à actualidade e a questões relacionadas com a estética e a filosofia da arte.
Com regularidade faz crítica literária, inicialmente em Colóquio/Letras e, depois, no JL – Jornal de Letras, onde assina uma “Crónica de Poesia”.
Obras de poesia suas receberam vários prémios literários, nomeadamente os prémios de poesia da Associação Portuguesa dos Escritores e do Pen Clube.
Recebeu também o Prémio de Ensaio da Câmara Municipal do Porto e de tradução de poesia da Fundação Calouste Gulbenkian e Paulo Quintela da Faculdade de Letras de Coimbra.
Em 2006 foi-lhe atribuído pela Universidade de Évora o Prémio de Ensaio Vergílio Ferreira, tendo em vista o conjunto da sua obra ensaística.
Trabalhou como investigador no Centro de Literatura da Universidade do Porto e, presentemente, no Centro de Estudos do Pensamento Português da Universidade Católica Portuguesa.